Instruction Bash if else ne reconnaissant pas les caractères +/-

Je tente de lire un fichier, ligne par ligne, et à chaque itération, vérifie le cinquième élément du tableau, qui sera un caractère + ou – (plus ou moins). Je suis capable de lire le fichier ligne par ligne, mais je ne peux pas obtenir la déclaration if / else à reconnaître le +/-.

Code Bash j’ai écrit

#!/bin/bash # save the field separator old_IFS=$IFS while IFS=$'\t' read -r -a myArray do echo "${myArray[5]}" if [ $myArray[5] = "+" ]; then echo plus elif [ $myArray[5] = "-" ]; then echo minus else echo no fi done < /Users/Alex/Desktop/test.bed # restore default field separator IFS=$old_IFS 

Entrée de l’échantillon

 Scaffold1 34 39 name . - Scaffold1 12 17 name . - Scaffold1 17 12 name . + Scaffold1 43 49 name . + Scaffold1 45 48 name . - 

Sortie de l’échantillon

• commande awk pour imprimer les 5 dernières lignes si elles correspondent
• Utiliser Awk pour imprimer une colonne si seulement elle répond aux critères
• Extraire les données de la variable dans Unix
• lire les données d’un fichier en utilisant bash et obtenir une sum pour certaines colonnes avec awk
• combinaison de deux fichiers pour obtenir un% de différence dans unix

 - no - no + no + no - no 

Sous chaque +/-, il devrait dire plus ou moins mais au lieu de cela, il indique non, indiquant que les instructions conditionnelles ont échoué. Une fois cette sortie correctement, je vais changer les commandes d’écho pour faire de l’arithmétique sur la colonne 2 ou 3 en fonction du signe.

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 ${myArray[5]} 

 $myArray[5] # this is equivalent to "${myArray[0]}[5]" 

 case ${myArray[5]} in -) echo minus ;; +) echo plus ;; *) echo no ;; esac 

 while IFS=$'\t' read -r scaffold num1 num2 name dot col _; do : "$col" refers to your fifth column here done